Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80Q6ZPV2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80Q6ZPV2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80Q6ZPV2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80Q6ZPV2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80Q6ZPV2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80Q6ZPV2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ino80Q6ZPV2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80Q6ZPV2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms