Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smpd4Q6ZPR5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpd4Q6ZPR5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms