Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Glis3Q6XP49 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Glis3Q6XP49 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms