Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp8b3Q6UQ17 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms