Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300aQ6SJQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300aQ6SJQ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms