Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GcsamQ6RFH4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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