Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scaf4Q6PFF0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf4Q6PFF0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms