Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmeff1Q6PFE7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms