Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Zbtb40Q6PCS8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zbtb40Q6PCS8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms