Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BC061212Q6P8K3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BC061212Q6P8K3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms