Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl3Q6P1Y1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl3Q6P1Y1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms