Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd11Q6NS46 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd11Q6NS46 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms