Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc66Q6NS45 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms