Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms