Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms