Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms