Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms