Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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