Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp7Q6A4J8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp7Q6A4J8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms