Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc1Q69ZZ6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms