Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp248Q640N4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms