Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Polr2kQ63871 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms