Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vil1Q62468 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vil1Q62468 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms