Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SypQ62277 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SypQ62277 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SypQ62277 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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