Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sprr1bQ62267 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sprr1bQ62267 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms