Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six3Q62233 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms