Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msi1Q61474 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msi1Q61474 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms