Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smarcd1Q61466 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd1Q61466 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms