Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcolceQ61398 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PcolceQ61398 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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