Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Foxd1Q61345 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd1Q61345 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms