Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ift20Q61025 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ift20Q61025 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms