Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atf3Q60765 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms