Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samhd1Q60710 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samhd1Q60710 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms