Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgaeQ60677 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms