Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprnQ60673 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprnQ60673 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms