Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HnrnpdQ60668 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HnrnpdQ60668 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms