Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Satb1Q60611 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms