Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3aQ60520 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3aQ60520 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms