Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsr1Q5SWD9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms