Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd40Q5SUE8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms