Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sft2d1Q5SSN7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms