Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AbrQ5SSL4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms