Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trdv4Q5R1A3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv4Q5R1A3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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