Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkaa1Q5EG47 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms