Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2bQ56A07 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms