Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eme2Q56A04 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms