Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms