Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm527Q4KL13 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm527Q4KL13 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms