Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrc43Q3V0L5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc43Q3V0L5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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