Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prr7Q3V0I2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prr7Q3V0I2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prr7Q3V0I2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prr7Q3V0I2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prr7Q3V0I2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr7Q3V0I2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prr7Q3V0I2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms